Vielen Dank für die Antwort.Hat sich schon erledigt das Problem.

Irgendwo in den Einstellungen war bei "Stereomix" ein Häckchen zuviel. Dadurch hat Cubase auch bereits aufgenommene Spuren wieder mit aufgenommen und alles gedoppelt.Genauso wie den Klick eben.
Achja,ich habe Cubase AI 4.